El Golfo San Matías presenta varias especies de moluscos de valor comercial. Almejas púrpura, panopea y navaja, vieira tehuelche, mejillón, cholga y ostra plana son blancos de pesquerías artesanales. Para potenciar el aprovechamiento de estas especies Río Negro desarrolló desde 1995 un Programa de Clasificación de Zonas de Producción marinas. La clasificación de estas zonas se basa en el monitoreo periódico de las variables que determinan la calidad sanitaria del ambiente en el que se producen moluscos bivalvos, tales como la presencia de bacterias coliformes, toxinas paralizantes, diarreicas y amnésicas, metales pesados y compuestos organoclorados.
En 1998, Río Negro clasificó la primera de estas zonas de producción en Argentina: la Zona ARRN-001, con la máxima categoría de calidad ambiental (A). La clasificación de esta zona se ajusta a los estándares nacionales (Resolución SAGPyA Nº 506/00) y a las normas de calidad higiénico-sanitaria de la Unión Europea para la producción y comercialización de moluscos bivalvos. En la actualidad, otras dos zonas de producción (ARRN002 y ARRN003) se encuentran en procesos de clasificación.
La clasificación de zonas de producción de moluscos bivalvos abre las puertas de los mercados internacionales a los productos de la pesca y de la acuicultura en la Patagonia.